在宇宙中未知的地方有一个由12个人类殖民地组成的星际世界。人类为了得到安逸的生活而制造了赛昂人，但赛昂人起来开始反抗人类。双方在血战之后停火，签署停战协议，赛昂人离开了殖民地去建立自己的家园。它们在这40年内没有与人类有任何联系，40年的和平让人类放松了警惕。人类对赛昂人的认识还停留在40年前，认为塞昂人只不过比toaster[ 烤面包机]强一点。40年后赛昂人通过早已安插在人类当中的与人类外表毫无差异的人形赛昂人[ no.6 ]这一新型生命体瘫痪了人类的防御系统，并借用核武器瞬时间摧毁了人类的12个殖民地以及除卡拉狄加以外的所有“太空堡垒“舰队。据估计应该有大约120艘太空堡垒被摧毁...因卡拉狄加的指挥官阿达玛拒绝接受计算机网络化，所以才侥幸存活下来。由此在赛昂人紧追不舍的情况下，阿达玛带领紧存的大约50,000名人类开始了寻找传说中的人类第13个殖民地-地球的旅程...