故事发生在一个日本海峡内的城市，故事的主人公是名为一桥百合绘的普通女初中生，在某一天奇迹般的变成了神仙。当她将这件事情告诉好友四条光惠的时候，四条理所当然的认为这是在开玩笑。可是这件事对作为来福神社长女的三枝祀来说可是非常吸引的。为了测试百合绘的能力三人来到了学校天台，因此遇到了被百合绘所暗恋的书法部唯一成员二宫健儿，随后祀察觉出了百合绘的心意，欺骗她说风大的时候在屋顶告白可以获得成功，单纯的百合绘却信以为真。百合绘念着“神中” 这样的咒语抱着可以起风的愿望，可是丝毫没有效果。次日夜里新闻发布说本地有一股名为“百合绘”的台风将要来临，这时四条等人才相信百合绘真的成为了神仙，并协助她驱逐台风。在第一次尝试失败后，百合绘一行三人发现在学校天台露宿的二宫被台风卷入空中，这一幕暴了百合绘的seed，哦不是，是激发了百合绘的潜能阻止了台风救下了二宫，并向他表白……